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首先說明為什么要在Linux下邊開發J2EE。思考了一下大致有以下幾點：
1，公司規定，:-)被強迫離開易用的windows了；
2，項目需要。這個因人而異，不好多說。
3，想換個環境。window確實用煩了，可憐的機器整天運行著javaw.exe和eclipse.exe之外，還要加一個甚至好些安全類軟件，生怕 病毒或者木馬來襲。除此以為，可能還有QQ,MSN，outLook之類的通信軟件，這樣一來消耗的資源可真就大了，電腦運行的速度可就真不敢恭維了，每 天老牛拉車似的。Linux下邊就清爽了許多，無需殺毒軟件，至少目前來說安全性不用管那么了，裸奔唄，最多開個防火墻。通信軟件有pidgin等這種多 協議的軟件，打開一個登陸多個號碼，太爽了！呵呵（具體對比還是用了Linux才知道:-)）
4，目前工作前景來看，Linux能帶給你的能力比window大多了哦。所以，盡量還是多學點東西吧。

那么究竟怎么配置J2EE開發環境呢？分以下幾步：
1，安裝JDK；
2，安裝eclipse；
3，安裝安裝Tomcat;
4，安裝數據庫

（以下均以 Ubuntu8.04hardy 示例，在Ubuntu8.04下均成功配置，其他版本Linux有少些不同，請注意）
安裝JDK：
1，這里示例安裝JDK5。打開終端，輸入
sudo apt-get install sun-java5-jdk
開始下載sun jdk1.5之后安裝。
2，安裝之前會有一個深藍色背景的sun公司給出的Agreement協議，用Tab鍵選擇Agree(同意)并回車，才開始進入安裝。安裝需要一小會。
3，安裝完成后配置環境變量。
sudo gedit /etc/environment
4，打開環境變量文件，在其中添加以下代碼：
CLASSPATH=.:/usr/lib/jvm/java-5-sun/lib
JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-5-sun
注意：其中java-5-sun是jdk所在的文件夾，可能和這不同。請在/usr/lib/jvm/查看您機器上安裝的文件夾名。添加完畢無誤請保存。
5，打開jvm虛擬機配置文件。
sudo gedit /etc/jvm
添加以下代碼到最上方：
/usr/lib/jvm/java-5-sun
注意java-5-sun還是你機器上jdk所在文件夾名。
6，打開終端，輸入java 或 javac進行測試，是否安裝成功。查看jdk版本號用javac -version。

安裝eclipse：
網上有很多eclipse的安裝方法，一般都是直接在源里安裝再添加插件的，本人覺得那樣太麻煩，費時間！推薦一個最簡單的辦法，那就是下載一個完全集成web開發插件的eclipse版本。
點擊 這里進入下載地址 。這可是大名鼎鼎的Lomboz直接集成所有web開發插件的eclipse哦。下載界面版本任選，但是一定要下載Linux (x86/GTK 2)平臺的安裝包!如果是要使用tomcat6及以上版本，請選擇3.2以上版本下載，3.2以下版本不支持。
下載好的包比方說是org.objectweb.lomboz-all-in-one-R-3.3-200710290621-linux-gtk.tar.gz。直接解壓到 home/你的用戶名 目錄下即可運行eclipse。
打開eclipse后，點擊window->perferences->Java->Buile path,選中folders；再->Compiles,確認Compiler compliance level后邊是5.0.（如果你想用jdk1.5來運行eclipse的話）（因為運行java時默認的1.4和5.0還是有差別的）。再 ->Installed JRES，這里可以看到你機器上裝的JDK.如果是Fedora,可能裝了其他的JDK,在這里可以去掉前邊的勾，不選擇它。
eclipse jdk配置完成。

安裝tomcat：
1,首先，不建議從源里安裝。源里的不是整個tomcat,單純
sudo apt-get install tomcat
默認是沒有webApps的。tomcat即使運行了也不會顯示http://localhost:8180那個頁面。需要再附加。所以還不如直接下載tomcat。
這里安裝tomcat5.5。
下載地址：http://tomcat.apache.org/
2,下載完成后，將包解壓至home/你的用戶名 這個目錄下。
3,配置tomcat:
首先打開
sudo gedit /etc/profile
添加
export CATALINA_HOME="你的tomcat5.5安裝目錄"
保存即可。
4，開啟tomcat:打開終端，先進入你的tomcat5.5安裝目錄，再運行startup.sh。代碼是
cd 你的tomcat5.5安裝目錄/bin
./startup.sh
如果配置正確，將顯示
Using CATALINA_BASE: 你的tomcat5.5安裝目錄
Using CATALINA_HOME: 你的tomcat5.5安裝目錄
Using CATALINA_TMPDIR: 你的tomcat5.5安裝目錄/temp
Using JRE_HOME: /usr/lib/jvm/java-5-sun
如果出現touch: cannot touch 等錯誤，找到提示出錯的文件夾，更改其權限為讀寫即可。代碼為
sudo chmod 766 需修改的目錄 -R
如果還不行，將該文件夾及子文件權限全部開放，在home目錄下，怎么更改都不會影響系統。進入需修改的目錄
cd 需修改的目錄
sudo chmod 777 * -R
在瀏覽器里輸入http：//localhost:8080如果出現tomcat那只小貓頁面，則配置成功了。
5,關閉tomcat：與開啟類似，命令為./shutdown.sh。

安裝數據庫：
1，這里以安裝postgreSQL為例。直接在源里安裝。打開終端：
sudo apt-get install postgresql
安裝完postgre后，將自動創建一個缺省的數據庫集群，且生成一個數據庫超級用戶postgres。
2，對數據庫用戶及權限進行設置了，首先要得到超級用戶postgres的一個Shell：
sudo -u postgres sh
3，在這個Shell中創建一個同你用戶相同的數據庫用戶
createuser -A -D -P 你的用戶名
4，為該用戶創建一個數據庫
createdb -O 你的用戶名 你想要的數據庫名字
然后
exit
可以通過如下代碼連接你的數據庫
psql 你在上邊起的數據庫名字
單純靠終端來管理postgreSQL，實在是太費勁了點。windows下邊有pgadmin3來管理PostgreSQL ，linux下邊同樣有。
5，安裝圖形化軟件 pgadmin3 來管理PostgreSQL 數據庫
sudo apt-get install pgadmin3
安裝完該軟件之后，pgadmin3 在“應用程序＞系統工具＞里。點擊打開后運行起來就和windows下邊沒什么區別了。

到此，J2EE環境就搭建起來了。下邊需要做什么呢？趕緊新建一個Dynamic web 工程，進行以下測試吧。！
您如果對Linux系統安裝還不是太了解，請先看 Linux學習系列之系統安裝

轉自【 http://www.blogjava.net/creasure/archive/2008/07/08/213284.html 】

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Linux下的J2EE（JAVA EE）環境配置指南